Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL1P28749 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL1P28749 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL1P28749 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL1P28749 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL1P28749 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL1P28749 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL1P28749 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL1P28749 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL1P28749 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL1P28749 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL1P28749 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL1P28749 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL1P28749 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL1P28749 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL1P28749 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL1P28749 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL1P28749 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL1P28749 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL1P28749 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL1P28749 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL1P28749 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL1P28749 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL1P28749 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL1P28749 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL1P28749 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL1P28749 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL1P28749 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL1P28749 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL1P28749 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL1P28749 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL1P28749 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL1P28749 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL1P28749 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL1P28749 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL1P28749 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL1P28749 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL1P28749 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL1P28749 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL1P28749 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL1P28749 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL1P28749 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL1P28749 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL1P28749 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL1P28749 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL1P28749 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL1P28749 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL1P28749 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL1P28749 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBL1P28749 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL1P28749 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL1P28749 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL1P28749 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL1P28749 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL1P28749 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL1P28749 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL1P28749 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL1P28749 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL1P28749 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL1P28749 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL1P28749 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL1P28749 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL1P28749 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL1P28749 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL1P28749 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL1P28749 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL1P28749 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL1P28749 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL1P28749 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL1P28749 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL1P28749 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL1P28749 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL1P28749 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL1P28749 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL1P28749 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL1P28749 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL1P28749 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL1P28749 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL1P28749 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL1P28749 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL1P28749 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL1P28749 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL1P28749 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL1P28749 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL1P28749 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL1P28749 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL1P28749 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL1P28749 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL1P28749 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL1P28749 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL1P28749 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL1P28749 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL1P28749 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL1P28749 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL1P28749 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBL1P28749 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBL1P28749 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBL1P28749 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBL1P28749 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBL1P28749 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms