Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLNP26678 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLNP26678 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLNP26678 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLNP26678 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLNP26678 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLNP26678 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PLNP26678 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLNP26678 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLNP26678 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLNP26678 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLNP26678 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLNP26678 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLNP26678 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLNP26678 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLNP26678 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLNP26678 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLNP26678 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLNP26678 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLNP26678 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLNP26678 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLNP26678 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLNP26678 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLNP26678 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLNP26678 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLNP26678 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLNP26678 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLNP26678 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLNP26678 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLNP26678 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLNP26678 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLNP26678 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLNP26678 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLNP26678 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLNP26678 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLNP26678 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLNP26678 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLNP26678 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLNP26678 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLNP26678 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLNP26678 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLNP26678 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLNP26678 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLNP26678 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLNP26678 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLNP26678 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLNP26678 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLNP26678 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLNP26678 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PLNP26678 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms