Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO1P25800 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO1P25800 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO1P25800 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO1P25800 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO1P25800 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO1P25800 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO1P25800 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO1P25800 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO1P25800 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO1P25800 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO1P25800 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO1P25800 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO1P25800 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO1P25800 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO1P25800 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO1P25800 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO1P25800 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO1P25800 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO1P25800 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO1P25800 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO1P25800 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO1P25800 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO1P25800 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO1P25800 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO1P25800 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO1P25800 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO1P25800 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO1P25800 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO1P25800 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO1P25800 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO1P25800 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO1P25800 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO1P25800 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO1P25800 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO1P25800 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO1P25800 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO1P25800 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO1P25800 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO1P25800 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO1P25800 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO1P25800 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO1P25800 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO1P25800 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO1P25800 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO1P25800 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO1P25800 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO1P25800 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO1P25800 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO1P25800 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO1P25800 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO1P25800 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO1P25800 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO1P25800 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO1P25800 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO1P25800 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO1P25800 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO1P25800 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO1P25800 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO1P25800 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO1P25800 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO1P25800 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO1P25800 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO1P25800 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO1P25800 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO1P25800 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO1P25800 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO1P25800 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO1P25800 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMO1P25800 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO1P25800 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO1P25800 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMO1P25800 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMO1P25800 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO1P25800 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO1P25800 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO1P25800 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO1P25800 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO1P25800 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO1P25800 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO1P25800 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO1P25800 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO1P25800 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO1P25800 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO1P25800 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO1P25800 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO1P25800 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO1P25800 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO1P25800 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO1P25800 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO1P25800 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO1P25800 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO1P25800 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO1P25800 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO1P25800 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO1P25800 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO1P25800 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO1P25800 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO1P25800 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO1P25800 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms