Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPH2P23942 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPH2P23942 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms