Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA5P22460 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNA5P22460 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA5P22460 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms