Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASA1P20936 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASA1P20936 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASA1P20936 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASA1P20936 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASA1P20936 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASA1P20936 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASA1P20936 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASA1P20936 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASA1P20936 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASA1P20936 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASA1P20936 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASA1P20936 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASA1P20936 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASA1P20936 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASA1P20936 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASA1P20936 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RASA1P20936 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASA1P20936 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASA1P20936 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RASA1P20936 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RASA1P20936 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RASA1P20936 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RASA1P20936 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RASA1P20936 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASA1P20936 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASA1P20936 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASA1P20936 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RASA1P20936 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASA1P20936 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASA1P20936 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASA1P20936 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASA1P20936 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASA1P20936 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASA1P20936 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASA1P20936 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASA1P20936 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASA1P20936 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASA1P20936 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASA1P20936 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASA1P20936 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASA1P20936 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASA1P20936 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASA1P20936 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASA1P20936 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASA1P20936 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASA1P20936 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASA1P20936 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASA1P20936 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASA1P20936 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASA1P20936 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASA1P20936 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RASA1P20936 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASA1P20936 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RASA1P20936 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RASA1P20936 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASA1P20936 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASA1P20936 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASA1P20936 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASA1P20936 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RASA1P20936 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASA1P20936 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASA1P20936 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASA1P20936 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RASA1P20936 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RASA1P20936 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASA1P20936 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASA1P20936 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASA1P20936 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASA1P20936 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASA1P20936 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASA1P20936 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASA1P20936 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASA1P20936 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASA1P20936 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASA1P20936 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASA1P20936 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RASA1P20936 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RASA1P20936 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RASA1P20936 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RASA1P20936 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RASA1P20936 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RASA1P20936 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RASA1P20936 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RASA1P20936 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RASA1P20936 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RASA1P20936 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RASA1P20936 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RASA1P20936 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASA1P20936 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASA1P20936 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASA1P20936 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASA1P20936 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASA1P20936 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASA1P20936 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASA1P20936 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASA1P20936 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASA1P20936 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASA1P20936 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASA1P20936 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms