Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTF3P20783 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTF3P20783 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTF3P20783 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTF3P20783 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTF3P20783 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF3P20783 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF3P20783 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF3P20783 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF3P20783 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF3P20783 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF3P20783 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF3P20783 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF3P20783 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF3P20783 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF3P20783 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF3P20783 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF3P20783 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF3P20783 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF3P20783 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF3P20783 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF3P20783 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF3P20783 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF3P20783 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NTF3P20783 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF3P20783 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF3P20783 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF3P20783 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF3P20783 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF3P20783 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF3P20783 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF3P20783 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF3P20783 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF3P20783 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF3P20783 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF3P20783 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF3P20783 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF3P20783 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF3P20783 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF3P20783 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF3P20783 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF3P20783 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF3P20783 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF3P20783 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF3P20783 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF3P20783 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF3P20783 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF3P20783 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF3P20783 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF3P20783 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF3P20783 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NTF3P20783 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTF3P20783 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTF3P20783 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NTF3P20783 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTF3P20783 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NTF3P20783 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTF3P20783 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTF3P20783 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTF3P20783 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTF3P20783 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTF3P20783 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTF3P20783 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTF3P20783 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTF3P20783 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTF3P20783 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTF3P20783 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTF3P20783 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTF3P20783 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTF3P20783 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTF3P20783 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTF3P20783 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTF3P20783 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTF3P20783 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTF3P20783 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTF3P20783 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTF3P20783 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTF3P20783 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF3P20783 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF3P20783 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF3P20783 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF3P20783 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF3P20783 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF3P20783 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms