Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP4AP20648 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP4AP20648 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms