Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCLP19338 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCLP19338 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCLP19338 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCLP19338 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCLP19338 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NCLP19338 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCLP19338 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NCLP19338 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCLP19338 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCLP19338 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCLP19338 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCLP19338 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCLP19338 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCLP19338 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCLP19338 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCLP19338 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCLP19338 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NCLP19338 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCLP19338 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCLP19338 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCLP19338 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCLP19338 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCLP19338 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCLP19338 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCLP19338 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCLP19338 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCLP19338 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCLP19338 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCLP19338 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCLP19338 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCLP19338 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCLP19338 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCLP19338 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCLP19338 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCLP19338 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCLP19338 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCLP19338 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCLP19338 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCLP19338 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCLP19338 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCLP19338 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCLP19338 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCLP19338 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCLP19338 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCLP19338 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCLP19338 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCLP19338 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCLP19338 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCLP19338 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCLP19338 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCLP19338 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCLP19338 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCLP19338 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCLP19338 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCLP19338 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NCLP19338 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCLP19338 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCLP19338 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCLP19338 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCLP19338 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCLP19338 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCLP19338 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCLP19338 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCLP19338 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCLP19338 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCLP19338 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCLP19338 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCLP19338 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NCLP19338 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCLP19338 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCLP19338 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCLP19338 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCLP19338 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCLP19338 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCLP19338 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCLP19338 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCLP19338 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCLP19338 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NCLP19338 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCLP19338 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCLP19338 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms