Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI1P19237 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI1P19237 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms