Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB6P18564 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB6P18564 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms