Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA1P17302 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA1P17302 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA1P17302 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA1P17302 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA1P17302 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA1P17302 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA1P17302 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA1P17302 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA1P17302 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA1P17302 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA1P17302 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA1P17302 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA1P17302 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA1P17302 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA1P17302 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA1P17302 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA1P17302 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA1P17302 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA1P17302 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA1P17302 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA1P17302 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA1P17302 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA1P17302 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA1P17302 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJA1P17302 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA1P17302 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA1P17302 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA1P17302 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA1P17302 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA1P17302 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA1P17302 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA1P17302 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA1P17302 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA1P17302 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA1P17302 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA1P17302 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA1P17302 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA1P17302 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA1P17302 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA1P17302 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA1P17302 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA1P17302 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA1P17302 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA1P17302 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA1P17302 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA1P17302 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA1P17302 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA1P17302 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA1P17302 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA1P17302 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA1P17302 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA1P17302 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA1P17302 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA1P17302 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA1P17302 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA1P17302 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA1P17302 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA1P17302 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA1P17302 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA1P17302 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA1P17302 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA1P17302 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA1P17302 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA1P17302 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA1P17302 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA1P17302 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA1P17302 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA1P17302 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA1P17302 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA1P17302 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA1P17302 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA1P17302 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA1P17302 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA1P17302 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA1P17302 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA1P17302 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA1P17302 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA1P17302 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA1P17302 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA1P17302 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA1P17302 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA1P17302 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA1P17302 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA1P17302 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA1P17302 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA1P17302 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA1P17302 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA1P17302 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA1P17302 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA1P17302 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA1P17302 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA1P17302 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA1P17302 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA1P17302 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA1P17302 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA1P17302 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA1P17302 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA1P17302 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJA1P17302 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms