Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAG1P15918 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAG1P15918 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAG1P15918 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RAG1P15918 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAG1P15918 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAG1P15918 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAG1P15918 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAG1P15918 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAG1P15918 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAG1P15918 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAG1P15918 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAG1P15918 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAG1P15918 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAG1P15918 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RAG1P15918 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAG1P15918 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAG1P15918 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAG1P15918 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAG1P15918 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAG1P15918 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAG1P15918 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAG1P15918 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAG1P15918 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAG1P15918 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAG1P15918 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAG1P15918 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAG1P15918 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAG1P15918 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAG1P15918 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAG1P15918 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAG1P15918 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RAG1P15918 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAG1P15918 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RAG1P15918 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAG1P15918 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAG1P15918 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAG1P15918 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAG1P15918 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAG1P15918 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAG1P15918 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAG1P15918 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAG1P15918 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAG1P15918 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAG1P15918 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAG1P15918 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAG1P15918 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAG1P15918 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAG1P15918 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAG1P15918 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAG1P15918 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAG1P15918 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAG1P15918 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAG1P15918 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAG1P15918 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAG1P15918 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAG1P15918 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAG1P15918 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAG1P15918 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAG1P15918 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAG1P15918 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAG1P15918 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAG1P15918 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAG1P15918 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAG1P15918 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAG1P15918 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAG1P15918 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAG1P15918 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAG1P15918 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAG1P15918 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAG1P15918 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAG1P15918 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAG1P15918 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAG1P15918 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RAG1P15918 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAG1P15918 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAG1P15918 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAG1P15918 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAG1P15918 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAG1P15918 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAG1P15918 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAG1P15918 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RAG1P15918 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAG1P15918 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAG1P15918 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAG1P15918 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAG1P15918 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAG1P15918 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms