Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAFP15056 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAFP15056 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAFP15056 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAFP15056 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRAFP15056 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRAFP15056 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRAFP15056 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRAFP15056 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRAFP15056 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAFP15056 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAFP15056 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAFP15056 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAFP15056 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAFP15056 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAFP15056 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAFP15056 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAFP15056 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAFP15056 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAFP15056 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRAFP15056 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRAFP15056 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRAFP15056 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRAFP15056 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAFP15056 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRAFP15056 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRAFP15056 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRAFP15056 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRAFP15056 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRAFP15056 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRAFP15056 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRAFP15056 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAFP15056 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAFP15056 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAFP15056 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAFP15056 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAFP15056 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAFP15056 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAFP15056 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAFP15056 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAFP15056 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRAFP15056 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRAFP15056 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BRAFP15056 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRAFP15056 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRAFP15056 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRAFP15056 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRAFP15056 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRAFP15056 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRAFP15056 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRAFP15056 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRAFP15056 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRAFP15056 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRAFP15056 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRAFP15056 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRAFP15056 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRAFP15056 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRAFP15056 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRAFP15056 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAFP15056 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAFP15056 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAFP15056 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAFP15056 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAFP15056 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAFP15056 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAFP15056 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAFP15056 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAFP15056 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAFP15056 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAFP15056 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAFP15056 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAFP15056 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAFP15056 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAFP15056 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAFP15056 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAFP15056 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAFP15056 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAFP15056 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAFP15056 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAFP15056 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAFP15056 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms