Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFAPP14136 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFAPP14136 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFAPP14136 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFAPP14136 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GFAPP14136 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GFAPP14136 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GFAPP14136 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFAPP14136 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFAPP14136 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFAPP14136 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFAPP14136 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFAPP14136 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GFAPP14136 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GFAPP14136 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFAPP14136 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFAPP14136 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GFAPP14136 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFAPP14136 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFAPP14136 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GFAPP14136 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFAPP14136 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFAPP14136 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFAPP14136 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFAPP14136 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFAPP14136 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GFAPP14136 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFAPP14136 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFAPP14136 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFAPP14136 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFAPP14136 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFAPP14136 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GFAPP14136 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFAPP14136 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFAPP14136 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFAPP14136 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFAPP14136 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFAPP14136 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFAPP14136 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFAPP14136 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFAPP14136 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFAPP14136 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GFAPP14136 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GFAPP14136 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GFAPP14136 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GFAPP14136 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GFAPP14136 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFAPP14136 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFAPP14136 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFAPP14136 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFAPP14136 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFAPP14136 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFAPP14136 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFAPP14136 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFAPP14136 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFAPP14136 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFAPP14136 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFAPP14136 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GFAPP14136 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GFAPP14136 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GFAPP14136 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GFAPP14136 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GFAPP14136 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GFAPP14136 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFAPP14136 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFAPP14136 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFAPP14136 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFAPP14136 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFAPP14136 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFAPP14136 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFAPP14136 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFAPP14136 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFAPP14136 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFAPP14136 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFAPP14136 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFAPP14136 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFAPP14136 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFAPP14136 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFAPP14136 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFAPP14136 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFAPP14136 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFAPP14136 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFAPP14136 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFAPP14136 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFAPP14136 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFAPP14136 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFAPP14136 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFAPP14136 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFAPP14136 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GFAPP14136 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GFAPP14136 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFAPP14136 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFAPP14136 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFAPP14136 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFAPP14136 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFAPP14136 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFAPP14136 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GFAPP14136 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFAPP14136 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFAPP14136 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms