Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRG2P13727 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRG2P13727 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRG2P13727 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRG2P13727 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRG2P13727 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRG2P13727 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRG2P13727 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRG2P13727 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRG2P13727 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRG2P13727 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRG2P13727 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRG2P13727 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRG2P13727 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRG2P13727 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRG2P13727 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRG2P13727 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRG2P13727 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRG2P13727 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRG2P13727 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRG2P13727 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRG2P13727 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRG2P13727 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRG2P13727 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRG2P13727 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRG2P13727 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRG2P13727 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRG2P13727 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRG2P13727 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRG2P13727 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRG2P13727 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRG2P13727 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRG2P13727 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRG2P13727 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRG2P13727 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRG2P13727 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRG2P13727 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRG2P13727 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRG2P13727 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRG2P13727 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRG2P13727 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRG2P13727 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRG2P13727 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRG2P13727 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRG2P13727 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRG2P13727 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRG2P13727 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRG2P13727 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRG2P13727 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRG2P13727 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRG2P13727 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRG2P13727 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRG2P13727 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRG2P13727 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRG2P13727 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRG2P13727 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRG2P13727 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRG2P13727 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRG2P13727 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRG2P13727 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRG2P13727 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRG2P13727 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRG2P13727 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRG2P13727 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRG2P13727 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRG2P13727 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRG2P13727 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRG2P13727 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRG2P13727 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRG2P13727 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRG2P13727 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRG2P13727 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRG2P13727 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRG2P13727 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRG2P13727 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRG2P13727 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRG2P13727 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRG2P13727 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRG2P13727 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRG2P13727 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRG2P13727 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRG2P13727 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRG2P13727 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRG2P13727 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRG2P13727 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRG2P13727 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRG2P13727 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRG2P13727 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRG2P13727 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRG2P13727 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRG2P13727 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRG2P13727 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRG2P13727 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRG2P13727 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRG2P13727 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRG2P13727 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRG2P13727 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRG2P13727 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG2P13727 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG2P13727 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms