Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCANP13611 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCANP13611 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCANP13611 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCANP13611 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCANP13611 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCANP13611 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCANP13611 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCANP13611 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCANP13611 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCANP13611 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCANP13611 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCANP13611 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCANP13611 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCANP13611 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCANP13611 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCANP13611 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VCANP13611 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VCANP13611 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VCANP13611 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCANP13611 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCANP13611 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCANP13611 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCANP13611 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCANP13611 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCANP13611 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCANP13611 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCANP13611 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCANP13611 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCANP13611 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VCANP13611 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCANP13611 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCANP13611 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCANP13611 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VCANP13611 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCANP13611 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCANP13611 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCANP13611 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VCANP13611 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCANP13611 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCANP13611 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCANP13611 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCANP13611 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCANP13611 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCANP13611 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCANP13611 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCANP13611 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VCANP13611 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCANP13611 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCANP13611 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCANP13611 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCANP13611 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VCANP13611 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCANP13611 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCANP13611 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCANP13611 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCANP13611 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCANP13611 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCANP13611 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCANP13611 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCANP13611 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCANP13611 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCANP13611 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCANP13611 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCANP13611 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCANP13611 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCANP13611 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCANP13611 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCANP13611 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCANP13611 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCANP13611 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCANP13611 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCANP13611 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCANP13611 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
VCANP13611 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCANP13611 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
VCANP13611 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCANP13611 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCANP13611 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCANP13611 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCANP13611 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCANP13611 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCANP13611 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCANP13611 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCANP13611 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCANP13611 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VCANP13611 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCANP13611 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCANP13611 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCANP13611 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VCANP13611 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VCANP13611 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCANP13611 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCANP13611 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCANP13611 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCANP13611 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCANP13611 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCANP13611 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCANP13611 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCANP13611 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms