Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDGF1P13385 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDGF1P13385 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDGF1P13385 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TDGF1P13385 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDGF1P13385 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDGF1P13385 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDGF1P13385 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDGF1P13385 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDGF1P13385 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDGF1P13385 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDGF1P13385 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDGF1P13385 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TDGF1P13385 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDGF1P13385 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms