Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEFA4P12838 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEFA4P12838 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms