Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
ACTN1P12814 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ACTN1P12814 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms