Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFHP12036 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFHP12036 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFHP12036 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFHP12036 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFHP12036 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFHP12036 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFHP12036 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFHP12036 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFHP12036 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFHP12036 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFHP12036 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFHP12036 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFHP12036 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFHP12036 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFHP12036 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFHP12036 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFHP12036 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFHP12036 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFHP12036 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFHP12036 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFHP12036 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFHP12036 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFHP12036 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFHP12036 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFHP12036 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFHP12036 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFHP12036 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFHP12036 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFHP12036 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFHP12036 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFHP12036 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFHP12036 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFHP12036 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFHP12036 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFHP12036 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFHP12036 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFHP12036 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFHP12036 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFHP12036 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFHP12036 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFHP12036 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFHP12036 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFHP12036 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFHP12036 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFHP12036 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFHP12036 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFHP12036 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFHP12036 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFHP12036 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFHP12036 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFHP12036 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFHP12036 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFHP12036 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFHP12036 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFHP12036 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFHP12036 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFHP12036 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFHP12036 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFHP12036 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFHP12036 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFHP12036 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFHP12036 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFHP12036 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFHP12036 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFHP12036 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFHP12036 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFHP12036 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFHP12036 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFHP12036 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFHP12036 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFHP12036 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFHP12036 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFHP12036 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFHP12036 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFHP12036 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFHP12036 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFHP12036 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFHP12036 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFHP12036 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFHP12036 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFHP12036 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFHP12036 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFHP12036 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFHP12036 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFHP12036 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFHP12036 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFHP12036 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFHP12036 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFHP12036 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFHP12036 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFHP12036 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFHP12036 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFHP12036 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEFHP12036 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEFHP12036 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEFHP12036 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFHP12036 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFHP12036 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFHP12036 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms