Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP3P10745 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP3P10745 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP3P10745 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP3P10745 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBP3P10745 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBP3P10745 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBP3P10745 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RBP3P10745 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBP3P10745 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBP3P10745 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBP3P10745 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBP3P10745 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBP3P10745 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP3P10745 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBP3P10745 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBP3P10745 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBP3P10745 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBP3P10745 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBP3P10745 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBP3P10745 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBP3P10745 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBP3P10745 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBP3P10745 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBP3P10745 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBP3P10745 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBP3P10745 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBP3P10745 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RBP3P10745 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBP3P10745 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RBP3P10745 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RBP3P10745 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBP3P10745 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP3P10745 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP3P10745 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP3P10745 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP3P10745 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP3P10745 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP3P10745 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP3P10745 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP3P10745 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP3P10745 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBP3P10745 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBP3P10745 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBP3P10745 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBP3P10745 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBP3P10745 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBP3P10745 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBP3P10745 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBP3P10745 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBP3P10745 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP3P10745 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP3P10745 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP3P10745 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP3P10745 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP3P10745 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP3P10745 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP3P10745 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP3P10745 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP3P10745 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP3P10745 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP3P10745 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP3P10745 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP3P10745 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP3P10745 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP3P10745 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBP3P10745 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBP3P10745 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBP3P10745 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBP3P10745 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBP3P10745 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP3P10745 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP3P10745 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP3P10745 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP3P10745 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP3P10745 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP3P10745 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP3P10745 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP3P10745 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP3P10745 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP3P10745 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP3P10745 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP3P10745 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP3P10745 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP3P10745 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP3P10745 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms