Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL3P10147 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL3P10147 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL3P10147 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL3P10147 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL3P10147 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL3P10147 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL3P10147 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL3P10147 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL3P10147 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL3P10147 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL3P10147 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL3P10147 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL3P10147 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL3P10147 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL3P10147 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL3P10147 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL3P10147 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL3P10147 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL3P10147 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL3P10147 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL3P10147 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL3P10147 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL3P10147 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL3P10147 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL3P10147 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL3P10147 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL3P10147 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL3P10147 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL3P10147 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL3P10147 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL3P10147 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL3P10147 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL3P10147 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL3P10147 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL3P10147 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL3P10147 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL3P10147 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL3P10147 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL3P10147 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL3P10147 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL3P10147 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL3P10147 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL3P10147 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCL3P10147 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL3P10147 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL3P10147 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL3P10147 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL3P10147 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL3P10147 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL3P10147 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL3P10147 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL3P10147 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL3P10147 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL3P10147 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL3P10147 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL3P10147 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL3P10147 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL3P10147 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL3P10147 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL3P10147 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL3P10147 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL3P10147 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL3P10147 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL3P10147 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL3P10147 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL3P10147 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL3P10147 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL3P10147 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL3P10147 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL3P10147 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL3P10147 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL3P10147 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL3P10147 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL3P10147 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL3P10147 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL3P10147 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL3P10147 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL3P10147 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL3P10147 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL3P10147 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL3P10147 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL3P10147 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL3P10147 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL3P10147 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL3P10147 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL3P10147 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL3P10147 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms