Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf88P0DMB2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms