Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC166P0CW27 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC166P0CW27 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.4 ms