Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.72■■■■■ 4.11
POLA1P09884 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
POLA1P09884 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
POLA1P09884 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
POLA1P09884 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
POLA1P09884 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
POLA1P09884 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
POLA1P09884 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
POLA1P09884 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
POLA1P09884 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
POLA1P09884 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
POLA1P09884 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
POLA1P09884 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
POLA1P09884 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
POLA1P09884 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
POLA1P09884 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
POLA1P09884 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
POLA1P09884 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
POLA1P09884 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
POLA1P09884 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
POLA1P09884 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
POLA1P09884 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
POLA1P09884 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
POLA1P09884 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
POLA1P09884 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
POLA1P09884 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
POLA1P09884 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
POLA1P09884 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
POLA1P09884 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
POLA1P09884 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
POLA1P09884 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
POLA1P09884 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
POLA1P09884 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
POLA1P09884 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
POLA1P09884 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
POLA1P09884 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
POLA1P09884 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
POLA1P09884 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
POLA1P09884 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
POLA1P09884 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
POLA1P09884 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
POLA1P09884 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
POLA1P09884 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
POLA1P09884 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
POLA1P09884 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
POLA1P09884 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
POLA1P09884 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
POLA1P09884 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
POLA1P09884 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
POLA1P09884 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
POLA1P09884 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
POLA1P09884 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
POLA1P09884 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
POLA1P09884 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
POLA1P09884 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
POLA1P09884 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
POLA1P09884 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
POLA1P09884 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
POLA1P09884 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
POLA1P09884 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
POLA1P09884 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
POLA1P09884 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
POLA1P09884 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
POLA1P09884 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
POLA1P09884 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
POLA1P09884 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
POLA1P09884 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
POLA1P09884 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
POLA1P09884 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
POLA1P09884 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
POLA1P09884 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC40.55■■■■■ 4.08
POLA1P09884 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
POLA1P09884 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
POLA1P09884 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
POLA1P09884 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
POLA1P09884 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
POLA1P09884 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
POLA1P09884 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
POLA1P09884 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.07
POLA1P09884 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.07
POLA1P09884 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.07
POLA1P09884 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
POLA1P09884 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
POLA1P09884 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
POLA1P09884 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
POLA1P09884 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
POLA1P09884 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
POLA1P09884 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
POLA1P09884 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
POLA1P09884 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
POLA1P09884 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
POLA1P09884 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.47■■■■■ 4.07
POLA1P09884 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
POLA1P09884 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
POLA1P09884 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC40.46■■■■■ 4.07
POLA1P09884 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
POLA1P09884 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
POLA1P09884 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
POLA1P09884 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
POLA1P09884 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms