Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA1P09110 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms