Protein–RNA interactions for Protein: P08172

CHRM2, Muscarinic acetylcholine receptor M2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM2P08172 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CHRM2P08172 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRM2P08172 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRM2P08172 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms