Protein–RNA interactions for Protein: P03897

MT-ND3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND3P03897 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-ND3P03897 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-ND3P03897 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-ND3P03897 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-ND3P03897 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-ND3P03897 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-ND3P03897 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND3P03897 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms