Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGAP02671 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGAP02671 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGAP02671 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGAP02671 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FGAP02671 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGAP02671 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGAP02671 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGAP02671 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGAP02671 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGAP02671 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FGAP02671 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGAP02671 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGAP02671 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGAP02671 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FGAP02671 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGAP02671 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGAP02671 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGAP02671 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGAP02671 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGAP02671 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGAP02671 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGAP02671 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGAP02671 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGAP02671 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGAP02671 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGAP02671 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGAP02671 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGAP02671 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGAP02671 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGAP02671 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGAP02671 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGAP02671 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGAP02671 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FGAP02671 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGAP02671 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGAP02671 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGAP02671 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGAP02671 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGAP02671 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGAP02671 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGAP02671 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGAP02671 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGAP02671 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGAP02671 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGAP02671 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGAP02671 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGAP02671 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGAP02671 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGAP02671 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGAP02671 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGAP02671 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGAP02671 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGAP02671 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGAP02671 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGAP02671 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGAP02671 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGAP02671 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGAP02671 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGAP02671 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGAP02671 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGAP02671 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGAP02671 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGAP02671 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGAP02671 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGAP02671 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGAP02671 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGAP02671 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGAP02671 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGAP02671 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGAP02671 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGAP02671 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGAP02671 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGAP02671 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGAP02671 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGAP02671 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGAP02671 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGAP02671 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGAP02671 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGAP02671 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGAP02671 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGAP02671 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGAP02671 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGAP02671 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGAP02671 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FGAP02671 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FGAP02671 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FGAP02671 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGAP02671 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGAP02671 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGAP02671 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGAP02671 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGAP02671 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGAP02671 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGAP02671 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGAP02671 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGAP02671 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FGAP02671 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGAP02671 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGAP02671 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms