Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC1P02654 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC1P02654 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC1P02654 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC1P02654 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC1P02654 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC1P02654 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC1P02654 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC1P02654 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC1P02654 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC1P02654 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC1P02654 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC1P02654 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC1P02654 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC1P02654 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC1P02654 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC1P02654 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC1P02654 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC1P02654 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC1P02654 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC1P02654 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC1P02654 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC1P02654 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC1P02654 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC1P02654 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC1P02654 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC1P02654 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC1P02654 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC1P02654 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC1P02654 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC1P02654 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC1P02654 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC1P02654 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC1P02654 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC1P02654 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC1P02654 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC1P02654 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC1P02654 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC1P02654 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC1P02654 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC1P02654 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC1P02654 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC1P02654 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC1P02654 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC1P02654 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC1P02654 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC1P02654 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC1P02654 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOC1P02654 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
APOC1P02654 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC1P02654 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC1P02654 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC1P02654 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC1P02654 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC1P02654 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC1P02654 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC1P02654 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC1P02654 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC1P02654 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC1P02654 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC1P02654 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC1P02654 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC1P02654 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC1P02654 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC1P02654 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC1P02654 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC1P02654 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC1P02654 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC1P02654 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC1P02654 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC1P02654 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC1P02654 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC1P02654 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC1P02654 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC1P02654 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC1P02654 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC1P02654 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC1P02654 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC1P02654 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC1P02654 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC1P02654 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC1P02654 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC1P02654 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC1P02654 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC1P02654 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC1P02654 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC1P02654 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC1P02654 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC1P02654 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC1P02654 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC1P02654 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC1P02654 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC1P02654 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC1P02654 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC1P02654 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC1P02654 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC1P02654 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC1P02654 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC1P02654 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC1P02654 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.5 ms