Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBC1P01850 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRBC1P01850 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBC1P01850 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms