Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11BO96011 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX11BO96011 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PEX11BO96011 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms