Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST3O95803 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST3O95803 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST3O95803 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST3O95803 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST3O95803 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDST3O95803 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST3O95803 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST3O95803 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST3O95803 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST3O95803 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST3O95803 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST3O95803 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST3O95803 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST3O95803 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST3O95803 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDST3O95803 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDST3O95803 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDST3O95803 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDST3O95803 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NDST3O95803 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDST3O95803 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST3O95803 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST3O95803 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST3O95803 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST3O95803 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST3O95803 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST3O95803 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST3O95803 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST3O95803 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST3O95803 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST3O95803 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST3O95803 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST3O95803 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST3O95803 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST3O95803 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST3O95803 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST3O95803 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST3O95803 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST3O95803 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST3O95803 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST3O95803 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST3O95803 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST3O95803 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST3O95803 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST3O95803 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST3O95803 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST3O95803 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST3O95803 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST3O95803 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST3O95803 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST3O95803 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST3O95803 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDST3O95803 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDST3O95803 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDST3O95803 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NDST3O95803 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NDST3O95803 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDST3O95803 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDST3O95803 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDST3O95803 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDST3O95803 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST3O95803 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST3O95803 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST3O95803 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST3O95803 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST3O95803 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST3O95803 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDST3O95803 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDST3O95803 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDST3O95803 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDST3O95803 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDST3O95803 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDST3O95803 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NDST3O95803 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST3O95803 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST3O95803 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST3O95803 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST3O95803 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST3O95803 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST3O95803 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NDST3O95803 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NDST3O95803 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NDST3O95803 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NDST3O95803 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST3O95803 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST3O95803 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST3O95803 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST3O95803 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST3O95803 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST3O95803 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST3O95803 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST3O95803 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST3O95803 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST3O95803 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST3O95803 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST3O95803 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST3O95803 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST3O95803 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST3O95803 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms