Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN9O95484 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN9O95484 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN9O95484 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN9O95484 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN9O95484 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN9O95484 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN9O95484 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN9O95484 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN9O95484 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN9O95484 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN9O95484 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN9O95484 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN9O95484 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms