Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRATO95237 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRATO95237 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRATO95237 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRATO95237 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRATO95237 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRATO95237 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRATO95237 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRATO95237 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRATO95237 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRATO95237 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRATO95237 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRATO95237 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRATO95237 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRATO95237 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRATO95237 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRATO95237 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRATO95237 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRATO95237 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRATO95237 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRATO95237 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRATO95237 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRATO95237 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRATO95237 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRATO95237 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRATO95237 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRATO95237 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRATO95237 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRATO95237 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRATO95237 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRATO95237 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRATO95237 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRATO95237 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRATO95237 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRATO95237 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRATO95237 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRATO95237 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRATO95237 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRATO95237 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRATO95237 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRATO95237 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRATO95237 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRATO95237 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRATO95237 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRATO95237 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRATO95237 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRATO95237 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRATO95237 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRATO95237 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRATO95237 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRATO95237 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRATO95237 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRATO95237 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRATO95237 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRATO95237 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRATO95237 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRATO95237 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRATO95237 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRATO95237 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRATO95237 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRATO95237 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRATO95237 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRATO95237 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRATO95237 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRATO95237 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRATO95237 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRATO95237 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRATO95237 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRATO95237 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRATO95237 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRATO95237 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRATO95237 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRATO95237 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRATO95237 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRATO95237 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRATO95237 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRATO95237 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRATO95237 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRATO95237 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRATO95237 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRATO95237 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRATO95237 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRATO95237 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRATO95237 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRATO95237 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRATO95237 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRATO95237 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRATO95237 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRATO95237 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRATO95237 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRATO95237 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRATO95237 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRATO95237 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRATO95237 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRATO95237 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRATO95237 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRATO95237 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRATO95237 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRATO95237 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRATO95237 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms