Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP5O95183 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP5O95183 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP5O95183 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP5O95183 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP5O95183 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP5O95183 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP5O95183 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAMP5O95183 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP5O95183 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP5O95183 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP5O95183 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP5O95183 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAMP5O95183 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VAMP5O95183 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAMP5O95183 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP5O95183 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP5O95183 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP5O95183 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP5O95183 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VAMP5O95183 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP5O95183 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP5O95183 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP5O95183 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP5O95183 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP5O95183 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP5O95183 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP5O95183 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP5O95183 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP5O95183 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP5O95183 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP5O95183 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP5O95183 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP5O95183 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms