Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF6O94906 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF6O94906 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF6O94906 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms