Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FLOT1O75955 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms