Protein–RNA interactions for Protein: O75677

RFPL1, Ret finger protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL1O75677 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFPL1O75677 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFPL1O75677 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFPL1O75677 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms