Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GCM2O75603 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM2O75603 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM2O75603 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM2O75603 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM2O75603 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM2O75603 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM2O75603 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM2O75603 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM2O75603 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM2O75603 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCM2O75603 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCM2O75603 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCM2O75603 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GCM2O75603 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCM2O75603 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCM2O75603 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCM2O75603 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCM2O75603 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCM2O75603 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCM2O75603 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCM2O75603 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCM2O75603 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCM2O75603 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCM2O75603 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM2O75603 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCM2O75603 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCM2O75603 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCM2O75603 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCM2O75603 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCM2O75603 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCM2O75603 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM2O75603 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM2O75603 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM2O75603 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM2O75603 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM2O75603 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM2O75603 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM2O75603 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM2O75603 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM2O75603 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM2O75603 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM2O75603 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCM2O75603 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCM2O75603 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCM2O75603 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCM2O75603 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCM2O75603 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCM2O75603 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCM2O75603 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCM2O75603 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCM2O75603 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCM2O75603 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCM2O75603 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCM2O75603 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCM2O75603 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCM2O75603 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCM2O75603 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCM2O75603 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCM2O75603 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCM2O75603 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCM2O75603 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCM2O75603 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCM2O75603 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCM2O75603 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCM2O75603 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCM2O75603 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCM2O75603 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCM2O75603 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCM2O75603 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCM2O75603 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCM2O75603 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCM2O75603 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCM2O75603 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCM2O75603 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCM2O75603 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCM2O75603 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCM2O75603 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCM2O75603 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms