Protein–RNA interactions for Protein: O75596

CLEC3A, C-type lectin domain family 3 member A, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3AO75596 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms