Protein–RNA interactions for Protein: O75596

CLEC3A, C-type lectin domain family 3 member A, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3AO75596 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC3AO75596 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC3AO75596 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms