Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC45O75419 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC45O75419 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC45O75419 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC45O75419 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC45O75419 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC45O75419 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC45O75419 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC45O75419 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC45O75419 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC45O75419 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC45O75419 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC45O75419 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC45O75419 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC45O75419 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC45O75419 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC45O75419 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC45O75419 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC45O75419 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC45O75419 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC45O75419 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC45O75419 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC45O75419 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC45O75419 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC45O75419 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC45O75419 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC45O75419 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC45O75419 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC45O75419 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC45O75419 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC45O75419 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC45O75419 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC45O75419 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC45O75419 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC45O75419 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC45O75419 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC45O75419 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC45O75419 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC45O75419 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC45O75419 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC45O75419 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC45O75419 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC45O75419 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CDC45O75419 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDC45O75419 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDC45O75419 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDC45O75419 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDC45O75419 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDC45O75419 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC45O75419 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC45O75419 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC45O75419 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC45O75419 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC45O75419 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC45O75419 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC45O75419 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC45O75419 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC45O75419 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDC45O75419 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC45O75419 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC45O75419 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC45O75419 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC45O75419 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC45O75419 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC45O75419 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC45O75419 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC45O75419 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC45O75419 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC45O75419 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDC45O75419 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CDC45O75419 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDC45O75419 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDC45O75419 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CDC45O75419 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC45O75419 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC45O75419 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC45O75419 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC45O75419 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC45O75419 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC45O75419 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC45O75419 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDC45O75419 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDC45O75419 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDC45O75419 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDC45O75419 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC45O75419 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC45O75419 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC45O75419 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC45O75419 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC45O75419 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC45O75419 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC45O75419 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC45O75419 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC45O75419 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC45O75419 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC45O75419 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC45O75419 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC45O75419 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC45O75419 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC45O75419 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms