Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC22BO75396 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC22BO75396 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22BO75396 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms