Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA2O75334 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPFIA2O75334 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA2O75334 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms