Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
KIAA0556O60303 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC38.41■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC38.38■■■■□ 3.74
KIAA0556O60303 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
KIAA0556O60303 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms