Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6DO43924 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE6DO43924 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE6DO43924 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms