Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRICKLE3O43900 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms