Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms