Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYTH3O43739 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYTH3O43739 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYTH3O43739 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYTH3O43739 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CYTH3O43739 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYTH3O43739 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CYTH3O43739 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYTH3O43739 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYTH3O43739 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYTH3O43739 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYTH3O43739 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms